O projeto estrutura-se a partir da semente e da consciencialização das crianças e jovens para a acelerada perda de biodiversidade.

Todas as atividades desenvolvidas (articuladas com os conteúdos programáticos do 2.º e do 6.º anos de escolaridade) têm como foco a preservação de sementes − idealmente tradicionais e locais −, abordando temas mais transversais ao meio ambiente, como os agro-sistemas, as alterações climáticas ou o pensamento sistémico. 

Através de atividades predominantemente práticas, pretende-se dotar os alunos de competências − conhecimentos, formas de ação prática ou pensamento crítico − que possam contribuir para uma ação de transformação do planeta em que vivemos.

O projeto «Germinar um Banco de Sementes» dá também resposta a grande parte dos pontos do «Greencomp» (quadro de referência para as competências de sustentabilidade a nível da UE, que indica pontos comuns para alunos e educadores), lançado pela União Europeia em 2021.